Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MTMR3Q13615 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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