Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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KCNMA1Q12791 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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KCNMA1Q12791 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNMA1Q12791 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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KCNMA1Q12791 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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