Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGM3Q08188 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms