Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LRP1Q07954 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms