Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms