Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIN1Q05586 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms