Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms