Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN7AQ01118 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN7AQ01118 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms