Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms