Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYBPC1Q00872 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms