Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBB4BP68371 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms