Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBA52P62987 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms