Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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