Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EEFSECP57772 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms