Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB25P57735 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms