Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP12AP54707 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms