Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms