Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA4P52798 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms