Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HK3P52790 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HK3P52790 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HK3P52790 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HK3P52790 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HK3P52790 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HK3P52790 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HK3P52790 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HK3P52790 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HK3P52790 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HK3P52790 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HK3P52790 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HK3P52790 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HK3P52790 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms