Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LUMP51884 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LUMP51884 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms