Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCT4P50991 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCT4P50991 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms