Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AMPHP49418 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMPHP49418 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMPHP49418 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMPHP49418 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms