Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNTAP49354 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNTAP49354 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FNTAP49354 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FNTAP49354 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNTAP49354 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNTAP49354 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms