Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms