Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms