Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNBP48739 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms