Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4P46934 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms