Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GNPDA1P46926 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms