Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRXP46100 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRXP46100 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRXP46100 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms