Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACADSBP45954 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms