Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms