Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TGFBR1P36897 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms