Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms