Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP5DP30049 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5DP30049 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms