Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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