Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN4P29074 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN4P29074 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms