Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD1P28340 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD1P28340 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms