Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXP28300 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXP28300 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LOXP28300 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms