Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR2AP28223 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms