Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms