Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNMT1P26358 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT1P26358 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms