Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA2P26232 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA2P26232 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms