Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2AP24928 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms