Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms