Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1P21675 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1P21675 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1P21675 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1P21675 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TAF1P21675 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms