Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF1P18846 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF1P18846 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms