Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC1P15941 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC1P15941 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC1P15941 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC1P15941 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC1P15941 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC1P15941 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MUC1P15941 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MUC1P15941 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MUC1P15941 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms