Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRF1P14222 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRF1P14222 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms