Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRG2P13727 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms