Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RARBP10826 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RARBP10826 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RARBP10826 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RARBP10826 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RARBP10826 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RARBP10826 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RARBP10826 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RARBP10826 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RARBP10826 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RARBP10826 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
RARBP10826 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms